Семь лет назад его приговорили к 25-ти годам тюрьмы за убийства, которые совершались при его участии в годы диктаторского режима. В 1981 г. правящий орган военной диктатуры — Совет государственной безопасности — назначил Альвареса президентом страны.
Грегорио Альварес был президентом Уругвая в период с 1981 по 1985 годы.
Альварес был схвачен в 2007.
Расследование правонарушений Альвареса началось уже в 2000-х годах, были доказаны сотни случаев злоупотребления властью, похищений, пыток, участие в убийстве по меньшей мере 37 человек.
Суд в 2009 г. признал его виновным в убийстве 37 деятелей оппозиции и в злодеяниях против человечности. Зимой 2016 г Альварес перенес инфаркт и был переведен в госпиталь.